Bassinovervågning Havnen er en af flotillens absolut vigtigste nøglepositioner. Derfor er det vigtig at haven kan bevogtes grundigt, så sejlende enheder trygt kan anløbe denne. Havnen vil i en skarp situation blive anløbet af mange andre enheder en flotillens eget skib, såsm søværnets enheder og enheder fra NATO. Havne vil ofte være mål for frømandsenheder som har havnens sejlende enheder som mål. Disse enheder bekæmpes også af bassinovervågningsenhederne. Enheder som indgår i bassinovervågningen uddannes på sammen høje niveau som enheder i bevogtningsgrupperne. Derudover lægges der meget vægt på uddannelse i gummibådsejlads når du er i en bassinovervågningsgruppe.